Il logo dell'Università "Magna Graecia" riproduce una moneta brettia (III secolo a. C.) raffigurante i Dioscuri a cavallo e, sotto, la scritta BPETTIWN. L'altra faccia della moneta mostra la testa dei Dioscuri. Il motto dell'Ateneo è: "Dubium sapientiae initium".

I colori dello stendardo dell'Università sono l'oro del logo e il rosso affiancato dal verde e dal blu.